车辆年检的投诉部门主要有以下几种选择：
交管部门：
可以向交管部门或其下属的车管所、交警大队进行投诉。对于检测站出具虚假检验结果等违规检验行为，可以拨打交管部门的举报热线电话26023093进行举报。
环保部门：
机动车年检的环保部分由地区环保机构负责，如果涉及环保方面的问题，可以向环保机构投诉。
技术监督局：
机械性能的检测由各地区技术监督局负责，如果对检测站的机械性能检测有异议，可以向技术监督局投诉。
运管处或运管所：
如果是交通的二级维护或综合检测，可以向运管处或运管所投诉。
消费者协会：
如果遇到机动车检测站人员工作态度差等问题，可以拨打12315投诉汽车检测站。12315是消费者投诉举报专线电话和全国互联网平台，具有非常高的权威性，可以有效维护消费者的合法权益。
建议根据具体投诉内容选择合适的部门进行投诉，以便更有效地解决问题。
