法院办理协议离婚的原因主要在于 尊重当事人的意愿并提供法律上的确认。以下是详细解释：
尊重当事人意愿：
协议离婚充分尊重婚姻双方当事人的主观意愿，这是婚姻自由原则的重要体现。通过法院调解，夫妻双方可以在平等、自愿的基础上协商解决离婚及其相关事宜，如子女抚养、财产分割和债务清偿等。
程序简便：
与诉讼离婚相比，协议离婚的程序更为简便快捷。只要双方达成一致意见，并签订书面离婚协议，就可以向婚姻登记机关申请离婚登记，一般不需要经过复杂的诉讼程序。
法律效力：
法院出具的民事调解书具有法律强制力，一旦经双方依法签收，对案件不再审理。这意味着协议离婚的内容具有法律约束力，可以确保双方按照协议内容履行各自的权利和义务。
避免纠纷：
协议离婚有助于在婚姻关系已经无法继续维持的情况下，由夫妻双方心平气和地解决矛盾冲突，避免互相指责和对立情绪，从而减少日后双方的仇视和对立。
保护合法权益：
协议离婚不仅要求双方离婚的合意，还要求对子女的抚养教育、财产的分割和债务的清偿等作出妥善安排，这有利于维护当事人双方及第三人的合法权益。
效率较高：
与诉讼离婚相比，协议离婚在时间上更为高效。如果材料齐全，半个小时左右即可办完协议离婚手续，而诉讼离婚则可能因财产分割等问题而耗时较长。
综上所述，法院办理协议离婚主要是为了尊重当事人的意愿，提供简便快捷的法律程序，并确保离婚协议的法律效力和双方权益的保护。
