公司申请停工需要遵循以下步骤：
提出申请
纳税人在营业执照核准的经营期内，向税务登记管理环节提出申请，领取并填写《停业登记表》。
受理审核
税务登记管理环节受理纳税人填写完毕的表格及有关资料，审阅填报的表格及有关资料是否符合要求。
停业处理
确认申请停业的纳税人税款已结清、发票已缴销，封存其税务登记证件，报领导批准后，核准其停业申请，制作《核准停业通知书》。
提交必要材料
申请停工留薪期确认通常需要向所在单位提出申请，并提供必要的证明材料，如医疗证明或其他相关文件。
等待审核
单位将根据相关法律规定和单位内部规章制度审核申请，并作出是否批准的决定。
确认停工留薪期
一旦申请被批准，与单位协商并确认停工留薪的具体期限。
遵守税收规定
如果公司因自然灾害、事故灾难、公共卫生事件、社会安全事件等原因造成经营困难，可以自主决定在一定时期内歇业，但需遵守税收规定，并及时向税务机关申报和补交税款。
恢复经营
如果公司想恢复生产，需要提前向税务机关提出复业申请，填写好复业申请登记表后，办理复业登记，税务部门同意后，领回税务登记证、发票领购簿及其之前交给税务部门的发票。
